我试图弄清楚如何处理耦合。我正在尝试对聚合物链进行建模。我必须处理相邻角之间的角度、二面角和振动。我能够分别计算所有三个：我通过计算力来创建一个加速度矩阵。加速度矩阵的行=维度，列=粒子。矩阵中的每个向量代表真实空间中的一个单体。然后，我将加速度矩阵乘以时间步长的平方并将其添加到初始位置。这让我知道了单体是如何进化的。但是，我不确定如何将这三个结合起来。由于大多数程序按顺序执行代码，我将如何解决这个问题？有没有通用的方法？我正在考虑两种方法：计算包括所有加速度及其耦合的有效加速度，并在获得所有加速度后校正加速度。还有其他方法吗？任何建议或参考将不胜感激。