有两个单独的问题：

1. 为了让 IDA 显示某些新格式的反汇编，它必须有一个加载器插件，它可以理解文件格式并为 IDA 提供有关如何从中加载数据和代码的信息。并且必须有一个处理器模块知道如何反汇编加载器插件加载的数据。否则 IDA 会将文件加载为二进制文件，仅此而已。
2. 即使您有加载程序 + 处理器模块，也不意味着您可以调试它。您需要一个调试器模块，它将知道如何将初始二进制文件加载到设备中，并且通过一些通信将在远程调试器中逐步运行它。

Nintendo 3DS 是 ARM11，所以 IDA 中有一个处理器模块。至于装载机，您必须搜索是否有人制作或自己实施。至于用于 IDA 的 3DS 调试器插件，我非常怀疑它是否存在。