根据上一个问题的答案,BUGS 和 R 中的参数化对于哪些分布不同?
我一直在将 R 参数化转换为 JAGS 参数化,但我遇到了错误,所以我提出了一个单独的问题来澄清转换是正确的。
R的?dweibull状态pdf(与和):
JAGS 手册将 pdf 声明为:
我可以看到 R 使用的参数化有但是 JAGS 参数化没有等效的. 但是当我拥有所有这些计算能力时,我无法让自己拔出铅笔。所以我做了以下经验证明,JAGS参数化不是简单地将形状转换为速率为:
下图代表两个样本(下面的代码),
- R(红色)从
- JAGS (蓝色) 从
library(rjags)
shape <- 2
rate <- 50
set.seed(0)
model.string <-
writeLines(paste("\nmodel{\nbeta ~ dweib (2,",1/rate,")\nY <- beta\n}"), con = 'weibulltest.bug')
j.model <- jags.model(file = "weibulltest.bug", data = list(x=NA)) #hack
mcmc.object <- coda.samples(model = j.model, variable.names = c('Y'), n.iter = 10000)
Y.jags <- as.matrix(mcmc.object)
Y.r <- rweibull(10000, shape, rate)
plot(density(Y.r), col = 'red', ylim = c(0,0.15))
lines(density(Y.jags), col = 'blue')