我正在测试许多（500,000）个基因变异，这些测试经过 FDR 校正并给我一个 q 值。通常我会把所有 q < .05 的东西都称为显着。但在这种情况下，我正在其他两个相关实验中测试这些相同的遗传变异（不使用完全相同的个体，但样本可能重叠）。该怎么办？将 q 的显着性阈值更改为 .05/3=.0167 是一种选择吗？非常感谢！
使用相同数据进行多次 FDR 校正实验
机器算法验证
假设检验
多重比较
2022-03-20 23:22:30
1个回答
答案将取决于您如何衡量错误（及其比例）。如果您关心每个实验中错误发现的比例，请单独进行 FDR 校正。如果您担心错误发现的“全球”比例，您可以将所有实验视为一个。这将保证全局 FDR 控制，但每个实验中的 FDR 不受控制。我相信您的建议是在两个级别上获得 FDR 控制的保守方法：在每个实验中和全球范围内。
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