我正在使用 Ubuntu18.04 和 Caffe 深度学习框架来做我的项目。但是，当我尝试备份我的项目时，我发现 Caffe 文件夹（从 GitHub 下载）无法复制或压缩。

这是我所做的：

1. 从 GitHub 下载 Caffe，并安装它。
2. 对我的项目的源代码进行一些修改。
3. 备份整个 Caffe 文件夹。但是，如果我将文件夹复制到 USB 闪存驱动器，我将有一个丢失文件的文件夹（我比较了两个文件夹的大小和文件数量）。如果我压缩文件夹然后将其复制到 USB 闪存驱动器，则会收到错误消息说我无法打开压缩文件。

我想知道我是否做错了什么，备份Caffe项目的正确方法是什么？

谢谢。